De Algemene Vergadering (AV) is het hoogste besluitvormende orgaan van NOC*NSF en stelt het instrumentarium vast voor het strategisch beleid, waaronder de Sportagenda, het Bestedingsplan en de Richtlijnen.

Het Bestuur is verantwoordelijk voor het gevoerde beleid en legt hierover verantwoording af aan de AV. Het interne toezicht binnen NOC*NSF wordt uitgeoefend door de Raad van Toezicht. De Raad legt aan de AV verantwoording af over de uitoefening van zijn statutaire taken.